De acuerdo con el informe de gestión sectorial 2006-2007, emitido por el Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial, los avances presentados en la gestión integral del recurso hídrico durante el mencionado periodo fue:

Mejoramiento de la capacidad de los laboratorios

En conjunto con el IDEAM, se realizó el diagnóstico del estado de los laboratorios del país e inició el proceso de mejoramiento de su capacidad a través del diseño y puesta en marcha de un plan de acción y de elaboración de protocolos para la medición de sustancias en agua tales como: metales pesados, plaguicidas y sustancias microbiológicas. Esto mejorará la certeza de la información recolectada y mejorará las condiciones de los laboratorios en su proceso de acreditación y por ende, la capacidad de respuesta de las CAR en relación con la calidad del agua.

Sistema de información del recurso hídrico

Para mejorar la administración del recurso hídrico, el Gobierno Nacional adoptó el Sistema de Información del Recurso Hídrico y el Registro de Usuarios del Recurso Hídrico, como módulo específico del Sistema de Información Ambiental para Colombia — SIAC, con el fin de mejorar los niveles de información en materia de balance hídrico regional y nacional de las CAR, el MAVDT y los Institutos de Investigación, así como la conformación del registro de usuarios del recurso hídrico.

Ordenación de cuencas

Se priorizaron actuaciones en 10 cuencas a saber: Río Páez, Río Guarinó, Río Guatiquía, Río Chicamocha, Río Bogotá, Río Medellín, Río Suárez, Río Sinú, Río Cali, y Río Combeima, con lo cual se espera mejorar los niveles de administración del recurso y intervenir de manera más efectiva la problemática que los afecta.

En desarrollo de los procesos de ordenación de cuencas las Corporaciones adelantan procesos de priorización de acuerdo a los criterios establecidos por el IDEAM; a finales de la vigencia 2006 se declararon en ordenación 2 cuencas: Río Prado y Río Coello en jurisdicción de Cortolima.